Probiotiques : bienfaits, aliments et compléments pour un microbiote équilibré

Que sont les probiotiques et à quoi servent-ils ?

Notre corps abrite des milliards de micro-organismes vivants (bactéries, levures, virus) qui forment ce qu’on appelle le microbiote. Présent dans l’intestin, la peau, la bouche ou le vagin, cet écosystème joue un rôle clé dans notre digestion, notre immunité et même notre humeur et interagissent en synergie avec notre corps.

C’est là que les probiotiques interviennent : ce sont des micro-organismes vivants spécifiques (bactéries ou levures), sélectionnés pour leurs bienfaits santé. Contrairement aux autres microbes de notre microbiote, les probiotiques sont consommés volontairement (via l’alimentation ou des compléments) pour renforcer ou rééquilibrer ces écosystèmes. Leur efficacité dépend d’une prise régulière et en quantité suffisante.

Un microbiote déséquilibré, ou dysbiose, favorise le développement de diverses affections : troubles digestifs, diabète, obésité, maladies auto-immunes, troubles de l’humeur, et certains problèmes de peau.

Les probiotiques peuvent aider à :

  • Renforcer la barrière intestinale et améliorer le confort digestif.
  • Soutenir le système immunitaire.
  • Favoriser le bien-être psychologique et la santé cutanée.

Cependant, l’efficacité des probiotiques dépend de chaque individu, car chaque microbiote est unique. Les bactéries ingérées ne s’installent généralement pas de façon permanente et nécessitent des prises répétées pour un effet durable.

De plus, Les probiotiques peuvent aider à rétablir l’équilibre, mais ils ne guérissent pas à eux seuls des maladies complexes comme le diabète ou les maladies auto-immunes (où une prise en charge globale est nécessaire).

Alimentation ou compléments alimentaires ?

Alimentation : la base pour un microbiote sain

« Que ton alimentation soit ta première médecine ! » disait Hippocrate

L’alimentation permet non seulement de nourrir notre corps mais également, modifier son alimentation est le moyen le plus durable de soutenir ses bactéries intestinales :

  • Fibres prébiotiques : endive, poireau, oignon, asperges, banane, fruits rouges, graines de lin. Elles servent de nourriture aux bonnes bactéries.
  • Aliments fermentés : yaourt, kéfir, choucroute crue, kombucha, qui apportent des bactéries vivantes.
  • Éviter les perturbateurs : aliments ultra-transformés, sucre, alcool, additifs, métaux lourds.
Aliment fermenté
Aliment fermenté

Pour les femmes enceintes ou allaitantes, privilégier les aliments fermentés doux comme le kéfir de fruits ou les yaourts maison, et évitez les aliments crus à risque (ex. : choucroute non pasteurisée).


Compléments alimentaires : quand et comment les utiliser

Les probiotiques peuvent être apportés en compléments alimentaires pour faire une cure de façon plus intense qu’avec l’alimentation. Ils apportent un bénéfice santé prouvé scientifiquement lorsqu’ils sont consommés en quantité suffisante (généralement plusieurs milliards d’UFC/jour).

Il est néanmoins important d’avoir en tête que les probiotiques apportés par compléments alimentaires occupent le microbiote pendant un certain temps (quelques semaines) mais ne le colonisent pas et finissent par disparaître.

Ils peuvent être utiles ponctuellement en cas de :

  • Troubles digestifs : diarrhée, constipation, syndrome de l’intestin irritable.
  • Après traitement antibiotique.
  • Allergies et certaines affections cutanées (dermatite atopique).
  • Soutien immunitaire et prévention de certaines infections.
  • Soutien digestif et prévention des infections respiratoires.
  • Accompagnement de troubles métaboliques ou psychologiques (sous supervision médicale).
  • Pendant la grossesse en prévision d’un accouchement par voie basse pour transmettre la meilleure flore bactérienne possible à son bébé.

Précautions et contre-indications :

  • Éviter ou adapter en cas de :
    • Terrain immunodéprimé important.
    • SIBO (small intestinal bacterial overgrowth) ou troubles digestifs sévères.
  • Arrêter en cas de survenue de symptômes persistants : gaz, douleurs abdominales, brouillard mental.
  • Attention : les probiotiques ne sont pas des médicaments. En France, seuls ceux portant la mention ‘souche déposée’ ou ‘garantie sans OGM’ offrent une traçabilité fiable.

Quels compléments alimentaires choisir ?

Selon l’OMS (2001) et la réglementation européenne, un probiotique doit être caractérisé par sa souche, sa dose efficace, et avoir fait l’objet d’études cliniques prouvant son bénéfice santé. Tous les micro-organismes vivants ne sont pas des probiotiques (ex. : les bactéries des yaourts classiques ne sont pas toujours des souches probiotiques documentées).

  • Choisir des souches documentées : Lactobacillus et Bifidobacterium sont les plus étudiées. Pour certains troubles digestifs, plusieurs souches en sinergie peuvent être plus efficaces.
  • Privilégier les gélules gastro-résistantes qui protègent la plupart des bactéries jusqu’au côlon (mais toutes les souches n’en ont pas besoin, comme Saccharomyces boulardii qui résiste naturellement).
  • Éviter les comprimés ou micro-encapsulés, dont la chaleur de fabrication peut tuer les bactéries.
  • Les cures sont souvent ponctuelles : quelques semaines à quelques mois selon les besoins.
  • Pour un effet probiotique, la dose doit être d’au moins 1 à 10 milliards d’UFC/jour (selon la souche et l’indication). Certaines gélules du commerce contiennent des doses insuffisantes.
  • Choisir des marques garanties sans OGM, avec une date de péremption claire (les probiotiques perdent leur efficacité avec le temps).

Quelles souches choisir en fonction de soi ?

Il est important de choisir des souches adaptées à son profil et à son objectif :

  • Prévention des diarrhées associées aux antibiotiques : Lactobacillus rhamnosus GG
  • Diarrhée infectieuse (surtout chez l’enfant) : Saccharomyces boulardii CNCM I-745
  • Dermatite atopique chez l’enfant : Bifidobacterium lactis
  • Infections vaginales (en association avec des antibiotiques) : Lactobacillus rhamnosus GR-1 et L. reuteri RC-14
  • Pour la grossesse : Lactobacillus rhamnosus HN001 est étudié pour réduire le risque d’eczéma chez le nourrisson (étude Pediatrics, 2019).
  • Pour l’immunité : Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12 est documenté pour soutenir les défenses immunitaires (études Cochrane).

Les probiotiques apportent des bienfaits réels, surtout pour la digestion et le confort intestinal. Mais leur effet dépend de la composition unique de chaque microbiote.

Pour soutenir durablement votre flore intestinale et votre santé, je peux vous accompagner dans la mise en place d’une alimentation diversifiée, riche en fibres et en aliments fermentés.

Si vous souhaitez aller plus loin, les compléments probiotiques peuvent compléter cette approche, et je peux vous conseiller pour choisir des compléments qualitatifs et adaptés à vos besoins.

Sources

  • Lanutrition.fr
  • Sincholle D., Super microbiote, 2022
  • Cotinat M., avis gastro-entérologue, 2025
  • Wilkins, T. et al. (2024). Probiotics for gastrointestinal conditions: A systematic review. Gut Microbes.
  • Zhang, Q. et al. (2025). The role of Bifidobacterium in infant eczema prevention. Journal of Allergy and Clinical Immunology.
  • Méta-analyses : diarrhée post-antibiotique, dermatite atopique, glycémie, infections respiratoires (Cochrane, 2019 et autres études)